沪宁城际铁路上海段呈Y型设计，在黄渡以南分岔，主线并行沪宁铁路经南翔、上海西站至终点上海站，而支线则通向虹桥枢纽站。市民可以在上海站、虹桥枢纽站乘坐沪宁城铁。

据介绍，沪宁城际铁路基本并行现有的沪宁铁路，起自上海，经昆山、苏州、无锡、常州、丹阳、镇江至南京，正线全长300公里，其中上海境内32公里，江苏境内268公里，全线共设置27个车站。

铁路第四勘查设计院有关负责人介绍说，沪宁城际铁路上海段经安亭在黄渡岔开，支线南行至虹桥站，正线平行目前沪宁铁路经南翔、上海西至终点上海站。沪宁城际铁路上海西站至上海站将利用6.7公里的既有线路，但上海西站将进行相应改造。沪宁城际铁路上海段共设上海站、上海西站、南翔站、虹桥枢纽站4个站。其中，南翔站位于嘉定区南翔镇西南约1000米处，车站东西两端分别有火车站路和翔黄公路通过，交通便利。

同济大学铁道与城市轨道交通研究院教授孙章说，沪宁城际铁路列车运营有3种方式：一种是直达，即上海至南京中间不停靠；第二种是间断停，俗称“大站车”；还有一种就是“站站停”。未来大站车和直达列车采用16辆列车编组，站站停列车则采用8辆列车编组。